本发明公开了一种集隔热和降温为一体的冻土区基础系统及施工方法，系统包括桩基础、散热系统、隔热系统和降温系统；桩基础包括桥墩、承台以及桩基；散热系统设于承台内；隔热系统设于承台的底部，包括碎石层、隔热层、垫层以及排风组件；降温系统包括将碎石层与外界相连通的通风组件和设于通风组件上的阀门；通过散热系统的散热通风管内的空气流动带走承台吸收太阳辐射而积攒的热量，进而达到承台降温的目的；通过隔热系统的双层隔热的功能，避免承台及桥墩的热量传递给冻土，同时阻止冻土内冷气向外释放；通过通风组件将碎石层与外界连通，降低隔热层的温度，进而降低冻土基础的融沉病害。